Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RTN1Q16799 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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