Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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