Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PRR4Q16378 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRR4Q16378 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms