Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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