Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CST6Q15828 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CST6Q15828 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CST6Q15828 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CST6Q15828 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CST6Q15828 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms