Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms