Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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