Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms