Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MLC1Q15049 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MLC1Q15049 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MLC1Q15049 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MLC1Q15049 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms