Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTP5Q14D33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms