Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHPRHQ149N8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms