Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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