Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SPIDRQ14159 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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