Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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