Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TUBA3CQ13748 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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