Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCH1Q13635 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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