Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TUBB3Q13509 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBB3Q13509 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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