Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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SP140Q13342 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP140Q13342 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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