Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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