Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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