Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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