Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CNTN1Q12860 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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