Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms