Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SREBF2Q12772 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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