Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAPQ12770 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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