Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RASGEF1BQ0VAM2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms