Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms