Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms