Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms