Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALD1Q05682 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms