Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPCQ03188 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms