Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms