Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms