Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms