Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3AP98173 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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