Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RELNP78509 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RELNP78509 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELNP78509 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms