Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms