Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RPS29P62273 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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