Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF10P55107 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GDF10P55107 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDF10P55107 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GDF10P55107 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDF10P55107 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms