Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP12AP54707 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms