Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCR4P51679 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms