Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSNK1EP49674 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms