Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOX2P48431 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX2P48431 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms