Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC6A9P48067 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms