Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPR4P46093 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPR4P46093 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPR4P46093 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms