Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCAMP43121 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCAMP43121 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms