Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPOP42166 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPOP42166 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms