Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDNFP39905 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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