Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGP37231 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGP37231 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms