Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 4040.8 ms